親切的服務來自快樂的員工,因此我們相當重視同仁們的工作環境、發展、照護及關懷勞工權益,管理局內部設有多向的溝通管道,公平對待與尊重所有員工,用心為同仁營造「安心職場」。人員進用完全受法令規範保障,不因個人之種族、宗教、膚色、黨派、年齡、性別、婚姻或身心障礙等差異而影響其任用、獎酬、升遷等應有權益。
所有正式員工皆具有公務人員身份,受「公務人員保障法」及「公務人員任用法」等法令保障,離職原因為退休升遷或職務異動而離開其職位,而各單位主管及執行者如有請假、異動、退休、離職之安排,期間之互補連結關係皆依「各機關職務代理應行注意事項」規定辦理;約聘僱人員則屬一年一聘僱制,故不適用勞基法之最短預告期之規定。
南科管理局為政府機關,未受工會法及職業安全衛生法規範,毋須設置工會及勞工健康安全委員會,且無職業病高風險人員,相關假勤制度,依據「公務人員請假規則」規定辦理,2019年職業病率、工傷率、死亡事故總數皆為0。
2019年有1位同仁申請育嬰留職停薪(男性1人),有1位同仁回復原職(男性1人);2018年有3位同仁申請育嬰留職停薪(女性2人、男性1人),有2位同仁回復原職(女性1人、男性1人);2017年無育嬰留職停薪復職人員。